肝囊肿的治疗应早发现早治疗，体积小，治疗效果快，无并发症，治疗较好，若直径大于五厘米出现压迫症状者，或有囊肿破裂，囊缔扭转，囊内出血或囊肿巨大者，需外科手术治疗.大部分先天性肝囊肿是在无意中发现的，而又无症状，所以不需治疗，只要定期复查。
肝囊肿，是一种较常见的肝脏良性疾病，可分为寄生虫性，非寄生虫性和先天遗传性。肝囊肿疾病原因大大部分系肝内小胆管发育障碍所致，单发性肝囊肿的发生是由于异位胆管造成。肝囊肿生长缓慢，所以可能长期或终生无症状，其临床表现也随囊肿位置，大小，数目以及有无压迫邻近器官和有无并发症而异。
肝脏的囊肿绝大多数都是先天性的，是肝内胆管胚胎发育障碍所致的，也有一小部分是后天性的，是因为肝脏的退行性改变所致，一般女性患者多于男性。肝脏的小囊肿是影像学检查中非常常见的一种良性占位，肝囊肿在肝内生长非常缓慢，小的肝囊肿对肝脏的内部组织结构受压或者外部的形态改变都没有任何影响。一般患者没有什么症状，在体检时偶然发现。
首先要明确是否有过炎症引起的囊肿，一般囊肿是一种良性病变，如果没有症状，可以观察，平时避免着凉和饮酒，注意个人卫生，一般药物明显效果，这么小的囊肿一般多不会有明显症状，如果增大或有症状可以手术治疗。
囊肿治疗的问题，其实存在这种疾病，本身属于良性的，不影响身体可以选择继续观察，定期复查B超就好了，如果变化不大的话，也不一定就要治疗，存在增大的话，那时再考虑手术。