直肠炎的治疗包括饮食治疗，腹泻期要注意补充营养，适当减少饮食中纤维素成分，以易消化富含叶酸、铁、钙、镁、锌等微量元素的流质饮食为宜。心理治疗，做好思想工作，尽量全身放松。
肠炎是细菌、病毒、真菌和寄生虫等引起的胃肠炎、小肠炎和结肠炎。临床表现有恶心、呕吐、腹痛、腹泻、稀水便或粘液脓血便。因此在日常饮食中要注意饮食卫生、加强运动、增强体质。现在应该注意，不要吃辛辣刺激性的食物，应该要多吃容易消化的食物，现在精神不要太过紧张，压力不要太大，现在饮食要有规律，这样是有利于治疗的。
直肠炎早期可以做肛肠镜或乙状结肠镜检查，涂片检查，粪便检查，大便培养检查，血清抗体检测，明确诊断之后使用药物进行治疗，不要吃辛辣和刺激性的食物，饮食口味要清淡。
直肠炎不是普通炎症。一般药物很难治疗，滥用抗生素进行消炎杀菌，不但不起治疗作用，反而容易引起肠道菌群失调。表面好像症状得到了控制，实际上病情是在逐渐发展。直肠粘膜水肿者，可用生理盐水等溶液灌洗直肠。平时注意饮食调节，多食蔬菜水果，多饮水，禁食辣椒，禁止饮酒。
如果是病毒性直肠炎，通常可以自愈。细菌性肠炎需要用抗生素和调节肠道菌群的药物进行症状治疗，否则症状会越来越严重。饮食应该清淡，易于消化。不应该吃生冷油腻的食物。应该保持腹部温暖，避免受凉。