乙脑疫苗包括乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，两种疫苗的接种时间是有区别的。首先是乙脑灭活疫苗是国家规定基础免疫共注射两针，出生后满6个月的婴儿，开始接种第一针，7到10天后接种第二针，一岁半到两岁左右，以及四岁的时候，各加强一针，六岁的时候再加强一针。其次是乙脑减毒活疫苗是1岁的时候接种第一针，2岁时加强免疫一针，7岁时再加强免疫一针。
国疫苗类的制剂都是生物制剂，所以注射后是会出现发烧、过敏等副作用的，宝宝的体温超过三十八度五口服药物控制体温，但如果持续时间长或口服退烧药物无法控制体温，再去检查。
疫苗接种前注意宝宝免疫抵抗力要好，近期没有感冒、发烧、过敏、腹泻、疱疹等系列疾病，患先天性免疫缺陷疾病、心脏病、肾炎、肝炎等不宜接种。接种后半小时留观，一天内不要洗澡，回家多喝水加速新陈代谢，接种的地方若出现硬结，不要过分担心，采用温湿毛巾热敷效果不错。
接种乙脑疫苗几乎没有什么副反应，个别的孩子会出现两天以内的轻微的发热的症状，均在38℃以下。此外七岁以上的孩子儿童如果是需要加强接种的时候，接种的部位可能会出现红肿，偶尔也有血管性的水肿和过敏性的休克，发生在注射后的10-30分钟。
白百破疫苗和乙脑减毒活疫苗是可以同时进行接种的。两种疫苗同时接种，一般不会增加疫苗接种后不良反应的发生几率。疫苗接种以后有可能在短时间内出现轻微的发热症状。应该间隔28天以上才接种。间隔开1个月接种，接种的时候注意多喂水，避免剧烈运动。注意接种百白破和乙脑减毒活疫苗时不要接种在同一条胳膊。
乙脑（减毒）疫苗和乙脑疫苗的区别，疫苗是一种病毒，而乙脑疫苗中的细菌经过技术处理完全丧失活性，而乙脑减毒疫苗仍保留一定的毒力但不足以致病，但缺点是免疫缺陷的人接种可能会导致意外，所以理论上灭活疫苗安全性更高，减毒疫苗免疫效果更好。
