巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，巧克力囊肿时会影响卵巢的排卵，导致卵巢的功能破坏，不排卵导致不孕。同时：子宫内膜症还有可能发生盆腔内，输卵管，子宫。卵巢的粘连，导致盆腔内的大部分器官完全粘连。
附件疾病如囊肿、肿瘤等不会导致阴道出血的。发现阴道不规则出血，应引起高度重视，及时检查，明确诊断后对因治疗。做一下阴道镜细查一下确诊，或是内分泌紊乱、服用药物等都有可能引起的。
痛经是巧克力囊肿最主要的症状，大部分人都会出现，但是也有少数病人没有明显的痛经症状。这种痛经为继发性且逐年加重，子宫内膜异位症痛经的特点多从月经前甚至周期后半期开始，持续整个月经期至月经后数日消失。疼痛部位多在下腹正中，或偏于一侧，病变浸及子宫直肠。
巧克力囊肿是肿块但并非肿瘤，如果囊肿较小，不会影响怀孕，如果较大直径达到或超过3厘米者，应及时采取治疗。手术去除后才能考虑怀孕。平日里注意饮食，不要吃辛辣油腻的食物，尽量避免性生活。必要时去医院就诊。
术后巧克力囊肿的一年复发率是10-18%，月经不来不一定会导致复发，还是上医院检查比较好，而且不健康的饮食易导致巧克力囊肿的复发。所以在日常饮食中要注意做好饮食调节，保证饮食多样化，及时补充人体所需的维生素及矿物质，多吃水果、蔬菜，增强人体抵抗力，从而可以有效预防巧克力囊肿复发。
巧克力囊肿是子宫内膜异位引起的，每来一次月经子宫内膜脱落，巧克力囊肿都会有一些变化的，巧克力囊肿会引起继发性痛经，那么平时就要注意，不要猛起猛蹲。避免扭转，不要激烈运动。
