男性不育的药物治疗主要有西医和中医两种。
西药可以分为多种，包括内分泌疗法，营养疗法，辅助疗法，还可以用来改善睾丸，促进微循环，维生素，抗生素。而且在中医看来，西医的作用更大。有补肾、补气、疏肝、清热药等。也就是说，中医和西医都可以用到。现在有很多西药，从临床上来看，对男性不育的治疗效果并不好，很多国外的指南都说，不建议用药，也不能确定。而中医和中药的治疗，效果更好，更准确。
正常情况，男性不育者服用的药物诗补肾强健的药物，对生育并没有太大的影响，因此在服药期间是可以怀孕的。需要注意的是，如果男性不育的原因未被治疗，精子质量不佳的话，后期会导致流产、死胎的情况。男性不孕者需要先根治不孕的原因后，在怀孕，对胎儿正常生长发育会比较好。备孕期间多吃营养健康的食物，补充身体所需的各种营养，加强锻炼，提高身体素质，保持愉快的心情。
治疗不孕不育最正规的男性医院是综合性的三甲医院或国家级的专科男性医院比较好。这两类医院在治疗，男性不育不育方面有国际领先的技术，医生专业性强，检测仪器先进，可以准确的找到致病因素后对症治疗，同时这两类医院有先进的试管婴儿技术，可以满足各种疑难杂症造成的不育。
首先去男科医院进行详细检查，并进行治疗。在日常生活中，必须注意宽松的内衣，尽量不要穿得太紧，并注意补肾饮食。可以酌情吃一些补肾食品。平时应该多注意休息，不要长时间熬夜。
以化验下精液，如果有精液异常，可以用药物调理下精液，然后规律作息和饮食，平时适当吃点黑色食物，部分严重的还需要进一步检查染色体，如果只是精子质量偏低所引发的，需要使用一些改善精子质量的药物如，注意补充微量元素，就可以改善。