牙齿根尖有阴影长脓包需要拔牙，因为炎症已经很厉害了，属于根尖周炎。导根尖周炎的最主要的致病原因是感染，常常继发于牙髓组织的感染坏死。急性根尖周炎主要症状为牙齿剧烈疼痛，不敢咬合，牙龈及面部肿胀根尖周炎症还可扩散到颌骨及周围组织，在抵抗力低下时，可形成颌骨骨髓炎及蜂窝组织炎。
根尖周炎不一定要拔。
对于根尖周炎，患者首先要进行的就是根管的处理，例如：急性根尖周炎会出现牙严重的疼痛，而慢性根尖周炎则会出现长期的炎症。如果是急慢性根尖周炎，如果牙体组织的缺陷不是很明显，并且可以进行根管治疗，如果不是很严重，可以进行根管治疗。牙体缺损较大，或是在进行根管手术后，由于感染无法得到有效的控制，需要拔牙。因此，根尖周炎的主要疗法就是保持牙的根管治疗法。
不管是急性根尖周炎，还是长期根尖周炎，只要牙体结构完好，即不存在明显的缺牙现象，或是没有出现明显的牙周疾病，都可以通过根管进行根管治疗。
根管疗法能有效地去除受影响的根管腔中的组织，使患牙尖周围炎症的牙齿得以保留。当然，根尖周炎患者患牙有较大的松动，且有较大的牙周疾病，且有较大的牙体缺陷，不能保留，则应进行拔牙。
在临床上，绝大多数的根尖周炎患者都不需要拔掉，只有一小部分患者需要拔掉。
这是因为大多数根尖周炎都可以通过正规的根管治疗来维持，即便是感染面积大，长期不愈，根尖囊肿的患者，也可以通过根尖手术或囊肿摘除术来维持。医生只会在适当的时机，将其拔掉，而不是针对缺损严重，没有保存价值的患牙。
因此，大多数根尖周炎的患者，并不一定要拔牙，只要进行根管治疗，就能保住。
对于牙科的根尖周炎，只要是具有一定的保存价值、没有明显的牙周疾病、没有显著的牙床退化、没有显著的松动，都可以进行根管手术来保存患牙，而不是拔牙。
如果是智齿，张口度不能保牙，也可能是没有对颌，也可能是智齿是阻生牙，又可能是因为这颗牙伴有牙龈萎缩，牙齿脱落，没有保存的必要，所以要拔牙，以免影响病情的恢复。
牙齿根尖周炎经根管治疗可得到有效控制，根尖炎症在根管治疗后得到控制。然而还有一部分病人牙根尖炎无法控制，很可能牙根发生了局部折裂，在此情况下才会拔牙。
如不拔牙，轻症脓包反复形成，反复发作，该处有部分炎性物质分泌。
严重者，久治不愈可形成颌骨囊肿、颌骨囊肿范围有大小之分、小者尚可、仅波及到牙、拔之即可。
在临床中，还会遇到部分颌骨囊肿较大，有可能不知波及边几颗牙，这类患者除手术外，还需对波及的牙进行根管治疗，因此发现牙根尖周炎需及时求医诊治。