两者手术的区别不大，包茎是阴茎勃起后，包皮口太小，导致龟头无法露出包皮，隐匿性阴茎是阴茎在体内，是一种先天性发育异常，多合并包茎，目前常进行的手术是包皮环切手术。
隐匿包茎可以使用药物等办法治疗，具体分析如下：
隐匿型阴茎通常是因为先天的肉膜层发育不良，导致阴茎体大部分埋在皮下，这种现象多发生在儿童和成年人身上。现在一般情况下，如果阴茎暴露在皮肤之上，低于1.5cm，需要怀疑是隐蔽的阴茎。如果要想治疗隐匿性阴茎，最好是去正规的泌尿外科进行隐匿性阴茎的整形手术，将隐藏在皮下的阴茎体取出来固定。
包茎是包皮口狭窄或包皮与阴茎头粘连，使包皮不能上翻外露阴茎头。包皮过长是包皮覆盖于全部阴茎头和尿道口，但仍可上翻。其实无论什么病都好，拥有好的心情和强健的体魄比任何治疗都好，建议生活上要多锻炼身体，随时保持微笑，对生活充满希望，病才能康复。
隐匿阴茎术后应避免剧烈运动，还应避免抓挠局部，可以服用一些药物。
3个月后要避免走路、骑车、性刺激等，避免因阴茎的反复勃起而导致伤口恢复。
手术后，局部会出现不舒服的情况，尽量不要去搔痒，在排泄完之后要擦拭，避免出现局部的炎症。
手术后2~3个月睡觉之前可以服用一些药物，可以服用一些雌性激素，避免阴茎勃起导致的疼痛和流血。
包茎一般可以选择以下非手术治疗或手术治疗。
1，非手术治疗一般适用于儿童和症状较轻的患者，用上翻包茎的方法可以进行有效的改善。
2，手术治疗适用于后天性包茎的患者，手术治疗可以达到彻底根治的效果，包茎容易反复发作，不及时治愈会影响患者平时的性生活，严重的话甚至会造成包茎癌，这时患者可以到正规的医院进行包茎环切手术，从而达到痊愈的效果。
建议患者注意个人卫生、养成良好的生活习惯。
