先天性癫痫分类治疗的药物有很多，具体的用药要视癫痫发作类型和病情状况而定。目前国内外对于癫痫的治疗主要以药物治疗为主。合理、正规的抗癫痫药物治疗是关键。癫痫病要依据类型用药，癫痫类型非常多。
对斜颈患儿，要被动牵拉矫正，即将患儿的头倾向健侧使健侧耳垂向肩部靠近，进行与畸形相反的方向运动。手法要轻柔，对肿物同时进行按摩，每次牵拉15—20次，一日4-6次。在日常生活中喂奶、睡眠的枕垫以及用玩具吸引病儿注意力，都可纠正姿态，有条件的可到医院由按摩师进行治疗。
先天性喉喘鸣一般是由于在妊娠期间营养不良导致胎儿缺钙引起的。发生在胎儿出生一到两个月以后会出现喉鸣的症状。如果宝宝的症状不严重，可以不用治疗，因为随着年龄的增大，喉软骨逐渐的发育，喉鸣的症状也会逐渐消失，像一般两到三岁的孩子就能够自愈。但是如果患者的情况比较严重，需要进行手术治疗。
儿童先天性心脏病是最常见的一种先天性畸形，它的预后跟类型和严重程度非常相关。最常见的先天性心脏病还是以房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等最为常见，这些都可以通过介入治疗的办法或者开胸手术的办法治愈，所以预后比较好。比较严重类型的先天性心脏病，比如法洛氏四联症、完全性的大动脉转位、完全性的肺静脉异位引流，可能在出生的时候就会比较危重，需要及时手术，也是可以治疗的。
轻度的房间隔缺损不影响孩子的心脏功能，中重度以上的都会对孩子的心脏功能有一定的影响，孩子会出现活动后出现胸闷气短，口唇紫甘的症状。严重的会发生心力衰竭，根据孩子的情况即时给予手术治疗。
更多可能为宝宝先天性的，出现隐睾的现象，是会导致宝宝的生育问题。到专业的泌尿外科和男科进行彩超，来明确判断睾丸的位置，这样才能进行手术治疗，同时要检查激素水平。这样的方法是比较安全可靠的。
