做羊膜腔穿刺术会伤胎儿。做羊膜腔穿刺术有一定的概率会损伤月齐带、胎盘、胎儿偶可发生脐带或胎盘血肿，或刺伤胎儿引起出血。若穿刺出血性羊水，应鉴别来自母体亦或胎儿，注意监测胎心，所以还是不要轻易手术。
羊穿是比较准确的，羊穿21三体提示胎儿是智障，需要引产。因为21三体的胎儿，出生后会表现为面容丑陋，智力低下，而且容易合并心脏病等多个脏器畸形。怀孕期间产检，主要是为了生个健康可爱的孩子。既然羊穿21三体，提示胎儿是畸形，就没有必要把孩子生出来。孕期行引产术，可以减轻家庭和社会的负担。下次怀孕更需要加强产检，避免畸形儿的出生。
一般来说羊膜腔穿刺术是存在风险的，只是风险不大。
首先穿刺的难度是会因人而异的，所以风险也会不同与胎盘的位置、胎儿的体位以及穿刺部位的羊水量有相应的关系。穿刺术是有可能会导致子宫感染或者是流产的情况出现的，所以在进行羊腔膜穿刺术最好选择公立的正规医院，在术后是需要孕妇卧床休息的。在孕期最好是定期的进行孕检，以保证胎儿的正常发育。
羊膜腔穿刺即羊水穿刺，是在超声引导下精准定位抽取羊水检测的，主要对胎儿染色体的甲胎蛋白、核型分析进行分析，也可进行基因和酶的检测判断某些遗传性疾病。
胎儿脱落的皮肤细胞和胎儿尿液中的肾脏细胞会在羊水中出现，检测人员抽取羊水后，经过培养、染色、离心、读片等处理过程，取得胎儿的染色体核型，另外还会对羊水进行甲胎蛋白检查。羊膜腔穿刺约有1/250~1/300的概率会发生各种风险，意味着每1000次穿刺中有3-4次可能发生危险，检查手段是安全的。羊膜腔穿刺失败一般是因为流产、出血、感染、胎儿损伤、羊水渗漏、子宫肌瘤、子宫畸形、腹壁太厚、羊水量少、胎盘位于子宫前壁等原因或因各种原因导致羊水细胞培养生长不满意或没有生长导致的，无法得出准确结论。
羊膜腔穿刺术存在感染的风险，羊膜腔穿刺术属于产科侵入性操作，有可能会引起宫腔感染，还存在胎膜早破的风险，进行穿刺术需要穿过羊膜，进入羊膜腔以内，这样会造成羊水外漏，引起胎膜早破。
羊水穿刺21三体不建议将胎儿生下来。
孕妇在做完羊水穿刺后，如果结果表明有21三体综合征，胎儿有先天愚型的情况，一般不建议保留胎儿，避免生下来后增加家庭负担。建议孕妇在孕早期及时补充叶酸，可以预防胎儿发育畸形，平时注意饮食均衡，可以多吃一些新鲜的蔬菜和水果，不要在有辐射的地方逗留，不可抽烟喝酒，养成良好的生活习惯，定期前往医院进行检查，排除胎儿发育异常。