隐球菌性脑膜炎要治愈，属较难，可出现不同程度后遗症，建议病人能及时就医处理，以免病情恶化。
对于早期阶段的隐球菌性脑病患者，可以使用抗生素来进行预防和治疗，但是如果在后期出现了感染症状，则需要采取手术或者其方法进行治疗，以防止进一步发展成为严重并发症而导致死亡。隐球菌性脑膜炎治疗原则是早期发现，早期处理，但是，由于新型隐球菌属于真菌，仅有少数抗真菌药物对其有治疗效果，因此，治疗时间将相对延长，还容易重复。
隐球菌性脑膜炎是一种以新的隐球菌感染脑膜和脑实质而引起的中枢神经系统的一种亚急性或慢性疾病。因该病病情进展严重，预后差，病死率高。但若及早发现并积极使用抗菌药物，则有生还的希望。
如果不及时治疗，患者往往几个月后就会死去，而接受治疗的病人，往往也会留下一些神经系统的并发症和后遗症。因此出现此病的患者，要积极进行治疗。
隐球菌脑膜炎，多数病人早期可以出现发热，一般病人的体温在37度5至38度之间，严重时可以出现头痛，恶心，呕吐，有些病人可以表现为视物模糊，也可能会出现意识障碍。病人可出现脑膜刺激征。病人可以出现眼球活动异常，也可以出现面瘫，听力障碍。有些病人可能会出现癫痫发作，也可出现精神症状，一部分病人可以出现偏瘫，共济障碍等。
脑膜炎具有共同的特点，即发热、头痛、呕吐、嗜睡或烦躁不安。再进展则可出现惊厥、昏迷。医生检查可有脑膜刺激征阳性、脑脊液改变等。但在新生儿及婴幼儿则临床表现可不典型，易于漏诊和误诊，延误治疗。
临床表现为脑膜刺激征和颅内压增高的症状，视盘水肿及后期视神经萎缩，不同程度的意识障碍。脑室系统梗阻出现脑积水。少数出现精神症状如烦躁不安、人格改变、记忆衰退。大脑、小脑或脑干的较大肉芽肿可引起肢体瘫痪和共济失调等局灶性体征。由于脑底部蛛网膜下隙渗出明显，常有蛛网膜粘连而引起多数脑神经受损的症状，蜗神经、面神经和动眼神经等较常累及。