对鼻窦炎进行外科治疗。该手术方法可完全治肛窦炎。只要精心护理，预后效果是比较理想的。目前，许多大型医院都开展微创手术，但鼻窦炎症也可以是微创手术。微创手术具有创伤小、恢复快的优点。
治疗肛瘘炎最佳方法是手术治疗，术后配合药物和一般治疗。手术治疗的具体方法有挂线疗法、瘘切开术、主灶切开对口引流法、瘘切除术、瘘切除术一期缝合术等治疗方法，具体选择是根据肛瘘内口位置、瘘的走向、瘘的深度等，综合评定后选择手术方式。
出现了肛窦炎如果是比较轻点的就可以选择药物，主要抗生素类药物消除炎症药物，如果是较严重的肛窦炎就要选择手术治疗了。肛窦由于其特殊的解剖结构容易出现炎症问题，基本上细菌的比较多，严重的可导致肛周脓肿的出现。
肛窦炎者表现为肛门坠痛、坠胀、肛门有灼热感、排便时疼痛，进行专科检查可看到，发炎的肛窦位置的有潮红、少量炎性渗出液、甚至脓液积聚在肛窦位置。在医生指导下通过，局部药物灌注，抗感染等药物进行治疗。
肛门会感觉到疼痛的，而且有时候会疼的很厉害，肛窦炎是一种可由各种因素导致的细菌感染所引起的发生在肛窦处的炎症性疾病，典型症状表现有肛内疼痛、瘙痒，肛门坠胀不适，伴排便不尽感及肛窦口分泌物增多。
直肠炎和肛窦炎都是比较常见的肛肠疾病，大多数是不良的生活饮食习惯和久坐造成的，恢复较慢，治疗后容易复发。可以使用溶液或者是中药灌肠治疗，配合使用药物进行治疗，要清淡饮食，避免烟酒刺激。