巧克力囊肿子宫内膜异位症的一种，是外源性子宫内膜异位症的一种，这种病在西医上北称为：“不死的癌症”是一种经久反复的疾病。这种病中医保守治疗。中医保守治疗只要对症就能见效，中医保守治疗后复发率低。对于有生育要求的，建议中医保守治疗。
一般建议手术之后至少休息一周的时间，在进行正常的活动，不建议过度的劳累，不要吃辛辣刺激生冷的食物，多注意休息，调整好心情，别喝凉的水和饮料，多吃些蔬菜水果，补充维生素增强微量元素。
卵巢巧克力囊肿术后伤口表面会出现肿胀，术后会有少量阴道出血，这是正常的，但如果阴道出血超过两周，我们必须去医院检查是否有任何异常现象。对于腹腔镜子宫切除术的病人，子宫切除术后破断端缝合阴道顶部，两周内棕色出血仍正常。
发现患有巧克力囊肿的时候一定要积极的进行手术的方式治疗，因为手术的方式治疗卵巢巧克力囊肿是目前为止能够较为彻底地清除囊肿的一种治疗方式，而且通过手术的方式还可以有效的缓解痛经，提高生活质量，对于有不孕症的病人，手术之后妊娠率能够得以提高。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，属于良性疾病，若是卵巢全切，是不会复发的，只要注意刀口的愈合不要感染就好。术后多进食营养高的食物，如鸡汤、鱼汤、鸽子汤等，促进刀口愈合，避免感冒，多吃红枣等食物防止贫血。
巧克力囊肿，会降低怀孕几率的，是手术治疗以后再怀孕比较安全。是治疗后在怀孕，以免引起怀孕几率下降。如果已经怀孕，巧克力囊肿是不会影响到胎儿发育的。如果怀孕后期没有骨盆异常可以尝试阴道分娩。