自然流产没流干净首先要检查B超，根据胚胎组织残留的大小，判断吃药还是手术治疗，具体情况如下：
若直径小于20mm的胚胎组织，可以益母草、五加生化胶囊等活血化瘀的药物，帮助排出胚胎组织。服药1周左右，判断药物治疗效果要去医院复查B超。服药期间适当活动，帮助排出组织物。同时，不吃生冷、辛辣、刺激的食物，可以吃一些蔬菜、水果等。若B超显示组织物直径超过20mm，且数量较多，通常吃药治疗效果不大，建议进行清宫手术。
自然流产后一般流干净了，具体分析如下：
自然流产可以排出体外，但也有一些身体素质比较弱的女性，会出现不洁的情况。如果是自然流产，一般在自然流产一周后到医院做详细的检查，如果还没有完全排出，一定要在医生的指导下进行清宫，避免感染，影响身体健康。如果已经排出了，日常生活中要注意清洁卫生，做好避孕措施，多吃一些有营养的食物，不要食用辛辣刺激性的食物，同时要把内裤和毛巾暴露在阳光下，消毒。
如果流的干净，自然流产流血，在1周之内能干净，并且掉出来的组织中，通过肉眼能看到白色肉样组织，掉胚胎组织过程中，可能流血稍多，掉完以后流血逐渐减少。如果1周之内，血流干净且没有腹痛，没有其他不适，可以考虑自然流产干净。
自然流产不干净的症状就是流血，如果自然流产，流血是在1周之内，也就是1周之内少量出血，在1周结束，属于正常的。要是不干净，会出现流血沥沥拉拉，并且有的人会伴有腹痛。
自然流产很容易清理。流产后，应及时去医院检查子宫内是否有残留物质，以免容易滋生细菌，引发妇科疾病。也可以服用消炎药。如果流产后长时间有恶露或异味分泌，应注意。手术后应该注意多休息。饮食主要是清淡的，容易消化。试着待在床上。
可以相对的使用促进胚胎排出的药物，也可以吃一些有助于胚胎排组织排出的食物，都会加速残留物的排出。残留比较，清宫较好，因为时间长可能导致粘在子宫壁上造成更大的伤害。
