先天性喉软骨发育不良是一种自限性的疾病。治疗的轻重在很大程度上决定。以补钙为主，避免仰卧刺激及胃食管返流。对于严重的先天性喉软骨发育不全或无法自行愈合的儿童，应行外科手术。
一、一般治疗以补钙为主，避免仰卧刺激及胃食管返流。对于营养不良，生长缓慢，已知有胃食道返流的婴幼儿，可以使用含抑酸剂和高卡路里的食物。
二、对于先天性喉软骨发育不良的药物治疗，目前还没有药物治疗。
先天性软骨发育不良应该通常可以采用以下方式进行治疗：
1.如果患者没有明显的临床表现，可以做屈伸运动抵抗电阻练习，主要是加强手指和脚部的肌肉功能，加强肌肉的强度和指脚趾的稳定。
2.如果病变局限，可以通过刮除移植来预防局部复发和恶性变，病变部位是长骨，恶性程度高，需要进行局部骨块或骨段的切除，以免出现恶性变化。
先天性软骨发育不良需要根据病变部位选择不同的治疗方法。如果头部发育不正常，要及时服用钙制剂和维生素D片。如果是胸骨部位的发育异常，这种现象是较为常见的，多会出现胸腔发育较小，胸椎向后凸等现象。还可能表现为手指粗大，下肢长短不一，逐渐出现四肢发育异常，应及时到专业康复机构进行牵引治疗，防止病症加重，影响身体健康。
通常来说，软骨发育不良建议进行药物治疗、手术治疗等。
软骨发育不良的临床上并没有特殊的治疗手段，只能通过对症的治疗，建议通过使用生长激素的方式进行一些改善，虽然并不能彻底治愈这种病，但是有助于控制病情发展。此外，软骨发育不良可能会导致腰椎管狭窄，出现神经根或脊椎受压的情况，需要采取外科手术，比如椎板切除、减压、椎间孔增大等。
先天性喉软骨发育不良主要表现是指哭闹有吸气性喘鸣，伴有呼吸困难，三凹征。轻症的宝宝没有症状，对发育和营养没有影响，主要是给宝宝补充钙，一般至2～3岁常能自己好。平时注意预防受凉及受惊，以免发生呼吸道感染和喉痉挛，加剧喉阻塞。如发作较重，吸气困难，可调整婴儿体位，取侧卧位可减轻症状，偶有严重喉阻塞者，需行气管切开术。
儿童喉软骨发育不良一般随着年龄的增长会逐渐发育，平时可以给孩子补充钙剂，可以让宝宝多晒太阳，坚持每天日光浴。在睡觉时候可以让宝宝侧卧位睡觉，并防治孩子受惊，以免引发痉挛。如发作较重，吸气困难，可调整婴儿体位，取侧卧位可减轻症状，偶有严重喉阻塞者，需行气管切开术。
