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研究发现跳跃基因在胃肠道癌症中更加活跃

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来源: 2016-08-06 11:00


近日发表的三项研究显示,一个名叫LINE-1的跳跃基因(jumping gene)在许多胃肠道肿瘤发生发展的过程中十分活跃。研究结果提示跳跃基因(也称为转座子)可能是早期癌症诊断的靶标。这3项研究分别发表在 《Nature Medicine》、《Genome Research》和《the Proceedings of the National Academy of Sciences》。


LINE-1转座子可以进行拷贝然后插入到基因组的新位点,很多情况下这种插入会破坏正常的DNA序列。


研究者说,跳跃基因插入到基因组的新位点并不少见,其中17%由LINE-1造成。


Haig Kazazian医生说:“我们要克服的一项挑战是,在基因组中已经存在这么多LINE-1拷贝的情况,如何检查到新的拷贝。这种情况就像是海底捞针。”


Haig Kazazian和同事设计了一种基因序列测序的方法用于寻找插入到基因组的LINE-1。研究者采用这种方法分析了结肠癌、胰腺癌和胃癌与它们对应的正 常组织的LINE-1插入基因组的情况,结果发现,LINE-1转座子在癌症发生的早期就开始插入到基因组中。例如,研究者发现结肠息肉中有29个新 LINE-1拷贝,而7例胰腺癌患者发现了24个新LINE-1拷贝。其中13个新LINE-1拷贝发现在原位肿瘤和转移性癌细胞中,由此提示,在肿瘤转 移之前,LINE-1插入到基因组的情况就已经发生了。这些LINE-1插入到基因组中的时间研究主要发表在《Genome Research》期刊。


发 表在《Nature Medicine》的研究由约翰霍普金斯大学的Kathleen Burns病理学副教授领导,主要关注的是胰腺癌患者的LINE-1情况。该研究对比了22例胰腺癌及其正常组织的LINE-1情况,结果发现,21患者 的肿瘤组织的LINE-1插入基因组,而正常组织无此情况。Burns说,这种情况在转移灶更加常见,因此,LINE-1插入到基因组可能是与癌症的进展 同时发生。


第三项研究主要由Tara Doucet负责,该研究主要是探讨LINE-1在食管癌和Barrett食管(食管癌的前期病变阶段)中的作用。结果显示,有些LINE-1新拷贝出现 在Barrett食管患者中,这些患者的Barrett食管经过15年或更久仍没有发展为癌症。有些LINE-1新拷贝则出现在Barrett食管和食管 癌患者中。


“关键的问题是,这些LINE-1新拷贝是否驱动癌症发展,或者只是癌症的副产物,”Kazazian说。为了回答这个问题,他的研究小组希望可以分析单个细胞的基因组,看看是否在癌细胞中常见的人LINE-1新拷贝在正常细胞中也存在。


Burns不管LINE-1在癌症生物学中的作用怎样,事实是与正常细胞相比,胃肠道癌细胞的转座子更加活跃,这种现象可以作为癌症早期诊断的工具。

(文章来源:Medicalxpress)


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关键词: 癌症 跳跃基因

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